猫的基因定序也出炉了！！

猫的基因定序也出炉了！！
www.med8th.com | 2007-12-20

Sciscape 科景编辑 malfada 报导，继人类、黑猩猩、大老鼠、小老鼠、狗和牛之後，第七种哺乳动物-猫的基因体初稿也出炉了！由於在许多疾病上猫与人的致病机转十分类似，这项成果也能帮助相关疾病的研究。

由美国国家癌症研究院的研究员Stephen O＇Brien和其研究小组此次完成了65％的家猫基因体初稿，家猫有38条染色体，约有27亿硷基对，20285个基因。这次的动物明星是一只四岁大，名叫「肉桂」的阿比西尼亚猫，或许这项研究成果第一个受惠者就是肉桂和它的家族。家猫的疾病中，有超过二百种与人类的疾病雷同，例如爱滋病、SARS、禽流感、白血病等。肉桂的血统中，就带有遗传性的视网膜色素变性，导致肉桂的左眼失明，人类也有这样的遗传疾病。

在家猫与人类的疾病中，家猫的免疫不全病毒（FIV）致病机转与人类爱滋病毒（HIV）非常相似。O＇Brien和其研究小组在2006年利用DNA序列，定出全球猫科动物的谱系图，确定猫科动物演化上的亲缘关系及迁徙。而家猫的基因组定序接着出炉之後，藉由猫科动物和FIV之间演化的研究，或许能为人类的爱滋病研究指引一个新方向。

2005年开始，美国国家人类基因研究院计画对26种哺乳类进行轻型定序（light coverage 2× whole-genome sequencing），包含大象、海豚、犰狳、蝙蝠和家猫。在以往，基因定序是耗时又花钱的工作。为了达到99％以上的正确率，必须重复的解读并组合基因片段，如人类的基因定序共解读了约7倍基因组的硷基对（相当於210亿个ATGC），花费了三十亿美元，如果要对哺乳动物进行大规模的定序，势必索费不赀。不过利用轻型定序的方式，科学家将家猫的基因序列和人、狗这些较完整的基因组比对，可以较快速的得到正确的序列和比较物种间的差异，这样定序初稿大约1千万美元就可完成。如此一来，藏在哺乳类基因中的演化讯息就可解开。当然， O＇Brien和其研究小组还是希望能在明年解读出完整版的家猫基因组。

原学术论文：Pontius JU et al., Initial sequence and comparative analysis of the cat genome. Genome Res. 2007 Nov;17(11):1675-89
O'Brien SJ, Johnson WE. The evolution of cats. Genomic paw prints in the DNA of the world's wild cats have clarified the cat family tree and uncovered several remarkable migrations in their past. Sci Am. 2007 Jul;297(1):68-75.

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