吴英恺从事外科和胸部及心血管外科医疗、教学、研究工作六十余年， 1940年在我国完成第一例食管癌切除、食管胃吻合手术； 1944年完成第一例未闭动脉导管结扎术； 1948年首次完成缩窄性心包炎切除； 1958年他组织了全国第一个食管癌防治科研协作组； 50年代后期在北京阜外医院组织开展心脏血管外科，在心脏外科、胸主动脉瘤外科及肾血管性高血压外科治疗方面做了开创性工作，进入七十年代他积极开展高血压、脑血管、冠心病的流行病学调查研究及人群防治工作，成立了第一个心血管病流行学与人群防治研究室，并组织了全国高血压普查，亲自组织和带领医务人员到工厂、农村、城市居民中开展高血压等常见心血管病的人群防治工作。到了晚年他仍继续关注和指导着各项医疗事业开展，尤其是面对我国人口高血压、冠心病、脑卒中（中风）的发病和死亡日益增多，已成为人民健康中最大威胁时，1997年由他倡导和亲自发动北京安贞医院、阜外医院、协和医院、友谊医院、全国高血压联盟等北京各医疗机构的医务工作者和首都新闻界、教育界、企业界热心人士共同计议，提出开展《首都爱心护心工程》，其宗旨是“人人献爱心，为保护人人的心血管健康做贡献”。积极编写心血管病预防保健科普材料，组织首都18个区县基层医师培训和各种类型面向群众的科普保健讲座，受到了领导和社会各届群众的好评。

    吴英恺教授对事业执着追求，治学态度严谨，医德高尚，思想活跃，思路宽广，善于钻研，敢于创新并十分重视总结经验，在学术上有着突出的贡献。 1985年出版了第一部由他一名中国人主编由12个国家150余名专家撰写的国际大部头著作《国际心胸外科实践》，在他70年的医务生涯中共发表论文200余篇，与有关同行合作，编著了《临床外科手册》、《胸部疾病》、《胸部外科》、《食管癌和贲门癌》等专著十余种。吴英恺教授是国内外医学界知名的社会活动家，几十年来
曾多次出国开会、讲学、访问，坚持以学术实力为基础的原则，做出了一流的学术贡献，分别获得苏联外科学会荣誉会员、英国心脏学会通讯会员、美国外科学会荣誉会员，美国胸部外科学会荣誉会员，北美外科医师学院名誉院士、国际外科学会副会长（1975--1977）。1955年当选为第一批中国科学院学部委员院士），还曾担任中华医学会外科学会主任委员、中华外科杂志主编、中华心血管病学会主任委员及中华心血管病杂志主编。

    吴英恺1956年加入中国共产党。他是全国人民代表大会第一、二、三届人民代表，全国政协第五，六届委员。